Оценка прогностической ценности структурной вариабельности генома для развития ишемической болезни сердца при сахарном диабете II типа у казахов

Индивидуальный регистрационный номер АР14872367

Период исполнения – 2022 -2024 гг.

Источник финансирования - Министерство науки и высшего образования Республики Казахстан (договор №176/30-22-24 от 18 октября 2022 г.).

Руководитель временного научного коллектива – Карабаева Раушан Жумартовна

Цель проекта. Определить прогностическую ценность структурной вариабельности генома, представленной 9 однонуклеотидными полиморфизмами   rs72652411, rs1011970, rs62560775, rs564398, rs10757278, rs4977574, rs1575972, rs1333051, rs2383208, в хромосомном сегменте 9p21.3, для развития ишемической болезни сердца (далее- ИБС) при сахарном диабете 2 типа (далее- СД2) у лиц казахской популяции.

Задачи проекта.

1. Сбор и свод фенотипических и генотипических данных о 600 участниках исследования.
2. Изучение фенотип/генотипических ассоциаций участников исследования с СД2, с ИБС, с СД2 и ИБС, без СД2 и ИБС.
3. Формирование выводов о прогностической ценности структурной вариабельности генома, представленной разными генотипами ОНП в хромосомном сегменте 9p21.3, для казахской популяции в сравнении с другими популяциями.  Оценка   возможности рассматривать хромосомный сегмент 9p21.3 качестве ключевого молекулярного механизма патологического взаимодействия ИБС и СД2. 
4. Разработка, согласно полученным научным данным, рекомендаций для клинической практики в Республике Казахстан. 

Ожидаемые результаты.

• Основанная на новых научных данных потенциальная молекулярная мишень для профилактики, диагностики и лечения ИБС и СД2 в казахской популяции. Результаты исследования, дающие новые знания о молекулярном пути ИБС и СД2, расширят представление об общих точках в патогенезе и будут иметь влияние на направления будущих исследований.
• 3 публикации в рецензируемом научном издании, индексируемом в Science Citation Index Expanded базы Web of Science и (или) имеющем процентиль по CiteScore в базе Scopus не менее 35, 1 статья в рецензируемом зарубежном или отечественном издании, рекомендованном КОКСОН, тезисы и 2 доклада на международных научно-практических конференциях, патент на полезную модель казахстанского патентного бюро, методические рекомендации.    

РЕЗУЛЬТАТЫ НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКОЙ РАБОТЫ

Полученные результаты полностью соответствуют задачам календарного плана на 2023-2024 годы и включают следующие виды работ:

Раздел календарного плана №1 - «Сбор фенотипических и генотипических данных об участниках исследования»: проведен набор 600 участников исследования, фенотипические данные по 128 показателям и 27 генотипических внесены в таблицу, проводилось второе чтение данных, устранены ошибки, проведена проверка сомнительных показателей. Для набора генотипических данных проведено генотипирование исследуемых SNP было проведено на приборе нового поколения QuantStudio 12K Flex, Life Technologies, использована микрофлюидная технология ПЦР в режиме реального времени (QuantStudio 12K Flex, Life Technologies).

Результаты фенотипирования и генотипирования 600 участников исследования сведены в статистическую таблицу и систематизированы согласно фенотипических групп. Для проведения генотипирования закуплены реактивы, сформирован перечень ОНП генетического локуса 9p21.3 для генотипирования.

Раздел календарного плана №2 - «Статистический анализ данных в соответствии с целью и задачами исследования»: проведен обзор 56 научных публикаций, отражающих значимость вариабельности в хромосомном сегменте 9p21.3 для развития ИБС и СД2, подчеркнул рост актуальности исследуемой проблемы в процессе развития понимания биологической роли.

Обзор "Evolution of the search for a common mechanism of congenital risk of coronary heart disease and type 2 diabetes mellitus in the chromosomal locus 9p21.3." опубликован в рецензируемом научном издании Medicine (United States, Wolters Kluwer Health), индексируемом в Science Citation Index Expanded базы имеющем процентиль по CiteScore в базе Scopus 70.

При статистическом анализе получены первые научные данные и результаты отражены в журнале Journal of Clinical Medicine of Kazakhstan (ISSN: 2313-1519), рекомендованном КОКСОН МНВО РК «CDKN2B-AS1 gene rs4977574 polymorphism in the severity of coronary artery disease in the Kazakh population». - Myngbay A, Alibekov S. - J CLIN MED KAZ. 2023; 20(6):23-5. https://doi.org/10.23950/jcmk/13918.

Раздел календарного плана № 3 - «Формирование выводов о прогностической ценности структурной вариабельности генома, представленной разными генотипами ОНП в хромосомном сегменте 9p21.3, для казахской популяции в сравнении с другими популяциями»:   

1.    Научная статья: Karabaeva RZ, Vochshenkova TA, Mussin NM, Albayev RK, Kaliyev AA and Tamadon A (2024) Epigenetics of hypertension as a risk factor for the development of coronary artery disease in type 2 diabetes mellitus. Front. Endocrinol. 15:1365738. doi: 10.3389/fendo.2024.1365738 (IF3.9; SiteScore Q2, Scopus 60 )

2.    Доклады и тезисы:

World Conference on Human Genomics and Genomic Medicine (WCHGGM - 24), 2nd - 3rd April 2024 in Boston, USA и RECENT ADVANCES IN MEDICAL AND HEALTH SCIENCES (ICRAMHS-2, 05 ^th - 06 ^th April 2024; New York, USA

• Nazira Bekenova, Alisher Aitkaliyev, Balzhan Kassiyeva, Tamara Vochshenkova "The Role of Polymorphisms in the 9p21.3 Locus in the Development of Ischemic Heart Disease in the Presence of Diabetes Mellitus" – Устный доклад
• Nazira Bekenova, Alisher Aitkaliyev, Balzhan Kassiyeva, Tamara Vochshenkova "Ischemic Heart Disease and Cardiac Autonomic Neuropathy: Common Patterns in Certain Links of Pathogenesis" – Постер

Collection of abstracts of the Multidisciplinary congress «WORLD QUALITY STANDARDS AND INNOVATIONS IN MEDICINE» and the International Scientific And Practical Forum «HIGH TECHNOLOGIES IN MODERN SURGERY»

• Balzhan Kassiyeva, Tamara Vochshenkova, Alisher Aitkaliyev, Nazira Bekenova «ISCHEMIC HEART DISEASE AND CARDIAC AUTONOMIC NEUROPATHY: COMMON PATTERNS IN CERTAIN LINKS OF PATHOGENESIS»
• Balzhan Kassiyeva, Tamara Vochshenkova, Alisher Aitkaliyev, Nazira Bekenova «THE ROLE OF POLYMORPHISMS IN THE 9p21.3 LOCUS IN THE DEVELOPMENT OF ISCHEMIC HEART DISEASE IN THE PRESENCE OF DIABETES MELLITUS».

3.    Охранный документ - Патент на полезную модель № 9094  «Способ прогнозирования риска ишемической болезни сердца на фоне сахарного диабета второго типа в казахской популяции» (Карабаева Р.Ж.; Бекенова Н.Б;   Айткалиев А.Д.;   Касиева Б.С.; Вощенкова Т.А.) опубликован  в бюллетене № 18 03.05.2024, МПК G01N 33/50 C12Q 1/00 C12Q 1/68 (2018.01).

Раздел календарного плана № 4 - «Разработка, согласно полученных научных данных, рекомендаций для клинической практики РК»: разработаны и опубликованы методические рекомендации «Однонуклеотидный полиморфизм rs564398 для прогноза совместного развития ишемической болезни сердца и сахарного диабета 2 типа в казахской популяции» (УДК:616-37:575. 2:616.12; ББК: 54.1; О-43. ISBN 978-601-7083-13-7) 

Контактные данные: Карабаева Раушан Жумартовна
+ 7 (7172) 70-80-90, вн. ном. 8003