Исследование видовой структуры кишечной микробиоты при инсулинорезистентности в казахской популяции

Индивидуальный регистрационный номер АР14871581

Период исполнения - 2022 -2024 гг.

Источник финансирования - Министерство науки и высшего образования Республики Казахстан (договор №176/30-22-24 от 18 октября 2022 г.).

Руководитель временного научного коллектива - Абильдинова Гульшара Жусуповна.

Цель проекта. Определить прогностическую ценность видового разнообразия кишечной микробиоты при инсулинорезистентности в казахской популяции.

Задачи проекта.

1. Сбор и свод фенотипических и генотипических данных о 200 участниках исследования; 
2. Изучение фенотипических ассоциаций участников исследования с использованием структуры кишечного микробиоценоза на основе секвенирования гена 16s рибосомальной РНК;
3. Формирование выводов о возможности управлять инсулинорезистентностью в казахской популяции, модифицируя видовую структуру кишечного микробиома.

Ожидаемые результаты.

• Основанные на новых научных данных дополнительные возможности для управления инсулинорезистентностью в казахской популяции через модификацию видовой структуры КМ в казахской популяции;  
• 2 публикации в рецензируемом научном издании, индексируемом в Science Citation Index Expanded базы Web of Science и (или) имеющем процентиль по citescore в базе Scopus не менее 35, 1 статья в рецензируемом зарубежном или отечественном издании, рекомендованном КОКСОН, тезисы и 2 доклада на международных научно-практических конференциях, методические рекомендации  

РЕЗУЛЬТАТЫ НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКОЙ РАБОТЫ

1.    Определение структуры кишечного микробиома в исследовании осуществлялось на основе выделения тотальной бактериальной ДНК и секвенирования по маркетному фрагменту вариабельных участков V2-4-8 и V3-6, 7-9 V3-V4 бактериального гена 16S рибосомальной РНК. После выделения ДНК из кала проведена подготовка библиотек и амплификация вариабельных участков V2-4-8 и V3-6, 7-9 гена 16S рРНК с использованием набора Ion 16S™ Metagenomics Kit и прибора Ion Gene Studio S5 Plus (США), согласно рекомендациям производителя. Затем амплифицированные фрагменты секвенированы с использованием набора Ion PGM Sequencing 400 на платформе Ion PGM и проанализированы с помощью модуля метагеномного анализа Ion 16S ™ в программном обеспечении Ion Reporter.

2.    Сформированы и проанализированы фенотипические и генотипические данные у 200 пациентов. В базе фенотипических данных - 87 признаков, в базе генотипических данных определены основные группы бактерий, которые разделены на классы и виды. Произведена сравнительная оценка по соотношению определенных видов бактерий в группе контроля и в группе исследования.

3.    Интерпретация результатов исследования с формированием научного продукта. Проведение комплексного и полипараметрического анализа микробиоты кишечника в исследуемых группах. Проводился многофакторный анализ и оценка кишечной микробиоты у 295 пациентов, на основе которого сформирована научная основа для публикаций в зарубежных научных журналах, индексируемые в базе SCOPUS и Web of Science.

Полученные результаты соответствуют задачам календарного плана на 2023-2024 годы и включают следующие виды работ:

1.    Опубликована статья в журнале «Frontiers in Medicine» Global Trends and Collaborative Networks in Gut Microbiota-Insulin Resistance Research: A Comprehensive Bibliometric Analysis (2000-2024). Manuscript ID: 1452227. Authors: Gulshara Zh Abildinova, Valeriy V Benberin, Tamara Vochshenkova, Alireza Afshar, Nadiar Maratovich Mussin, Asset Kaliyev, Zhussupova Zhanna and Amin Tamadon. Journal: Frontiers in Medicine, section Gastroenterology. Article type: Review Submitted on: 20 Jun 2024. Процентиль в Scopus- 85;

2.    Получен патент казахстанского патентного бюро на полезную модель «Способ прогнозирования риска развития инсулинорезистентности в казахской популяции». № охранного документа 9081, МПК: G01N 33/00 G01N 33/48 (2006.01). Номер и дата бюллетеня № 18 ­ 03.05.2024;

3.    Постерный доклад ЕР07.007 «Relationship of the species ratio of bacteria and the effectiveness of therapy for arterial hypertension in men and women with insulinresistance» European Society of Human Genetics 4-6 .06 2024. Berlin;  

4.    Постерный доклад «Relationship between gut microbiome and cardiovascular pathology in patients with insulinresistance» Dubai WordLab 26-30 May 2024 IFCC;   

5.    Доклад «Видовые характеристики микробиома» - Абильдинова Г.Ж. - Дни науки и инновации Nobel Fest Медицинские инновации  27-28 апреля 2024, г. Астана; 

6. Доклад «Современные аспекты значимости микробиома кишечника» - Абильдинова Г.Ж.- II Международная конференция «Здоровое поколение - Будущее Казахстана», 13-14 июня 2024, г. Алматы;

7. По результатам исследования разработаны методические рекомендации на тему: «Микробиом кишечника и маркеры инсулинорезистентности». ISBN 978-601-7078-16-4.

Контактные данные: Абильдинова Гульшара Жусуповна
+ 7 (7172) 70-80-90, вн. ном. 8134